Основными задачами совета являются подготовка предложений по определению основных направлений и механизмов модернизации экономики и инновационного развития России, включая разработку мер государственной поддержки в данной сфере деятельности, координация деятельности федеральных органов исполнительной власти, органов исполнительной власти субъектов РФ, органов местного самоуправления, предпринимательского и экспертного сообществ в области модернизации экономики и инновационного развития России. Кроме того, в число задач совета входит определение приоритетных направлений, форм и методов государственного регулирования в целях модернизации экономики и инновационного развития России, а также координация деятельности по реализации проекта создания и обеспечения функционирования территориально обособленного комплекса для развития исследований и разработок и коммерциализации их результатов.
Этим же указом президент упразднил комиссию по модернизации и технологическому развитию экономики России.